Arkeoloji Müzesi , 1891-1907 tarihleri arasında üç aşamada inşa edilmiştir. Yapının tasarımı A. Vallaury’e aittir. Müzenin ilk bölümü 1891’de, kuzey kanadı (1. Aneks) 1903’de, güney kanadı 1907’de tamamlanmıştır. Eklenen bölümlerle 192 m’lik bir uzunluğa ulaşan müze binası yaklaşık 9000 metre karelik bir alan kaplamaktadır. Mevcut yapıların, Eski Şark Eserleri ve Çinili Köşk müzelerinin kullanılmasına karşın yeterli olmaması ve özellikle modern müze işlevleri için gereken mekanlar açısından yeni bir yapıya gerek duyulmasından ötürü müze, 1984’te arka cephesine eklenen bir yapıyla genişletilmiştir. Yapının restitüsyon ve restorasyon projeleri firmamız tarafından hazırlanmış olup projeler Koruma Kurulu tarafından onaylanmıştır. T.C. Kültür ve Turizm Bakanlığı’na bağlı İstanbul Arkeoloji Müzeleri Gelişim Projesi kapsamında çalışmalarının planlama, projelendirme ve teknik yönetimi üstlenilmiş olup çalışmalara devam edilmektedir.